第二集中，尼奥（基努·里维斯 Keanu Reeves 饰）没有能从内部摧毁“母体”，他的身体在真实世界的飞船上陷于昏迷，思想却被困在介于“母体”和真实世界的中间地带，这个地方由“火车人”控制。墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 Laurence Fishburne 饰）和崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）等人知道了尼奥的情况，在守护天使的带领下， 找到了“火车人”的控制者梅罗纹...

讲述了四个陌生人的生活在澳大利亚沙漠中部的移民拘留中心产生交集：一个逃离危险邪教的空姐，一个逃离迫害的阿富汗难民和他的家人，一个逃离无前途的工作的年轻父亲，以及一个来不及遏制全国性的丑闻的官僚。...